28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0639 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0639  regulatory protein RecX  100 
 
 		 198 aa  388  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3541  hypothetical protein  43.2 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.795937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2037  regulatory protein RecX  42.78 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0520  regulatory protein RecX  47.98 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2558  hypothetical protein  39.27 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3064  hypothetical protein  39.78 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2303  hypothetical protein  42.01 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100929  hitchhiker  0.00859816 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0822  hypothetical protein  35.16 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1418  hypothetical protein  33.7 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2260  regulatory protein RecX  42.35 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.442098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4526  recombination regulator RecX  28.32 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4261  recombination regulator RecX  34.86 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3614  regulatory protein RecX  31.21 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0968404  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  31.98 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2578  hypothetical protein  40.69 
 
 		 160 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.458172 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2669  regulatory protein recX  27.97 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  36.97 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  30.51 
 
 		 264 aa  45.4  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  38.26 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  34.51 
 
 		 152 aa  45.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  38.28 
 
 		 163 aa  44.7  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  32.48 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  31.48 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  40 
 
 		 151 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  32.76 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  36.67 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0902  regulatory protein RecX  32.2 
 
 		 270 aa  42.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  32.76 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>