More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0106 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0675  putative carboxylase  63.89 
 
 		 538 aa  717    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2413  propionyl-CoA carboxylase  62.08 
 
 		 537 aa  659    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.193617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0327  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  62.89 
 
 		 536 aa  685    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0106  carboxyl transferase  100 
 
 		 539 aa  1099    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4463  propionyl-CoA carboxylase  64.31 
 
 		 551 aa  695    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1149  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  66.23 
 
 		 538 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0289  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  65.49 
 
 		 538 aa  697    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3260  propionyl-CoA carboxylase  63.08 
 
 		 540 aa  680    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.395839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3201  propionyl-CoA carboxylase  63.45 
 
 		 538 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349643  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2435  Propionyl-CoA carboxylase  63.33 
 
 		 540 aa  687    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176472  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2774  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  66.05 
 
 		 538 aa  722    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2204  propionyl-CoA carboxylase  62.71 
 
 		 540 aa  680    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.354632  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1721  carboxyl transferase  63.75 
 
 		 539 aa  673    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2929  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  66.42 
 
 		 538 aa  723    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0113  carboxyl transferase  98.14 
 
 		 539 aa  1080    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.495482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4183  propionyl-CoA carboxylase  60.67 
 
 		 553 aa  615  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1897  propionyl-CoA carboxylase  62.8 
 
 		 538 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2804  propionyl-CoA carboxylase  53.52 
 
 		 538 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896335  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2818  propionyl-CoA carboxylase  53.16 
 
 		 536 aa  550  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0599136  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2691  propionyl-CoA carboxylase  52.32 
 
 		 538 aa  545  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165728  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3947  carboxyl transferase  52.13 
 
 		 538 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26720  putative biotin-dependent carboxylase  51.76 
 
 		 538 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2266  putative biotin-dependent carboxylase  51.39 
 
 		 538 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0317  carboxyl transferase  48.05 
 
 		 537 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4767  carboxyl transferase  51.25 
 
 		 533 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.339159  decreased coverage  0.0000347279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4327  propionyl-CoA carboxylase  50.86 
 
 		 533 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0134236 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2067  propionyl-CoA carboxylase  45.56 
 
 		 536 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2123  propionyl-CoA carboxylase  45.76 
 
 		 535 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  45.12 
 
 		 554 aa  455  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  45.94 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  45.56 
 
 		 536 aa  457  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1883  propionyl-CoA carboxylase  48.94 
 
 		 542 aa  458  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314426  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_004310  BR0019  carboxyl transferase family protein  46.13 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  45.74 
 
 		 536 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  46.13 
 
 		 535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4433  Propionyl-CoA carboxylase  48.41 
 
 		 532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0300749 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0038  propionyl-CoA carboxylase  45.94 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  45.94 
 
 		 535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0016  carboxyl transferase family protein  46.13 
 
 		 535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1607  carboxyl transferase domain-containing protein  46.13 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  45.57 
 
 		 535 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0653  carboxyl transferase domain-containing protein  46.13 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390861  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2055  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  46.31 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.370981  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0803  carboxyl transferase domain-containing protein  46.13 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0470  carboxyl transferase domain-containing protein  46.31 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  45.76 
 
 		 535 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  45.57 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  46.13 
 
 		 535 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  45.08 
 
 		 534 aa  451  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  45.2 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  44.75 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  45.57 
 
 		 535 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  45.2 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1958  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  46.31 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4848  propionyl-CoA carboxylase  51.15 
 
 		 549 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789174  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4686  propionyl-CoA carboxylase  48.07 
 
 		 530 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4377  Propionyl-CoA carboxylase  46.02 
 
 		 536 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4354  propionyl-CoA carboxylase  46.75 
 
 		 534 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3224  propionyl-CoA carboxylase  45.57 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.809195  normal  0.0163606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4306  propionyl-CoA carboxylase  48.07 
 
 		 530 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609915  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2728  propionyl-CoA carboxylase  45.39 
 
 		 535 aa  448  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0541  carboxyl transferase domain-containing protein  46.13 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1361  propionyl-CoA carboxylase  45.39 
 
 		 535 aa  450  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4392  propionyl-CoA carboxylase  48.07 
 
 		 530 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0163  carboxyl transferase  46.27 
 
 		 530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000870722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2829  propionyl-CoA carboxylase  45.02 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16510  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  51.9 
 
 		 528 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10992  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD2  47.17 
 
 		 529 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  45.39 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6357  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  47.85 
 
 		 527 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1857  propionyl-CoA carboxylase  47 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  46.51 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  46.61 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3128  propionyl-CoA carboxylase  45.57 
 
 		 535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0763689  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49550  Acyl-CoA carboxylase  47.05 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461683  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3044  Propionyl-CoA carboxylase  44.9 
 
 		 534 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.932612  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  45.39 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38460  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  47.2 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.509026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  44.83 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  45.57 
 
 		 535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1718  propionyl-CoA carboxylase  45.57 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  46.51 
 
 		 535 aa  445  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1896  3-methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  45.2 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  45.02 
 
 		 535 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5055  carboxyl transferase  45.21 
 
 		 554 aa  442  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2798  propionyl-CoA carboxylase  45.27 
 
 		 553 aa  445  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2571  propionyl-CoA carboxylase  44.46 
 
 		 535 aa  444  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2246  propionyl-CoA carboxylase  45.45 
 
 		 552 aa  443  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2118  propionyl-CoA carboxylase  45.12 
 
 		 540 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0930  carboxyl transferase  45.39 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0422748  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1671  carboxyl transferase  45.57 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3275  acyl-CoA carboxyltransferase subunit beta  47.2 
 
 		 535 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4722  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  44.87 
 
 		 542 aa  442  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3561  propionyl-CoA carboxylase  44.83 
 
 		 535 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.507215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  45.59 
 
 		 546 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1465  propionyl-CoA carboxylase  45.59 
 
 		 535 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3832  propionyl-CoA carboxylase  45.12 
 
 		 540 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  45.77 
 
 		 535 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2323  propionyl-CoA carboxylase  45.2 
 
 		 535 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2395  propionyl-CoA carboxylase  45.39 
 
 		 535 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.955899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>