18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4732 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4732  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  761    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.972118  normal  0.160192 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5216  hypothetical protein  30.97 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2612  hypothetical protein  31.61 
 
 		 331 aa  169  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0209  hypothetical protein  37.32 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0264  hypothetical protein  36.96 
 
 		 294 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2921  hypothetical protein  30.72 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3731  hypothetical protein  33.94 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3434  hypothetical protein  30.38 
 
 		 339 aa  157  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5496  hypothetical protein  29.75 
 
 		 351 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000328707  normal  0.790551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1889  hypothetical protein  30.66 
 
 		 310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4274  hypothetical protein  29.22 
 
 		 368 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2160  hypothetical protein  29.75 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0111  hypothetical protein  24.37 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.260276 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4065  hypothetical protein  27.23 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2874  hypothetical protein  21.33 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0732457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1275  hypothetical protein  26.4 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6163  hypothetical protein  24.64 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0408502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0397  hypothetical protein  22.94 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000547863  hitchhiker  0.000221535 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>