123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0912 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0912  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0843  hypothetical protein  98.91 
 
 		 274 aa  553  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2291  hydrolase alpha/beta fold domain-containing protein  66.79 
 
 		 273 aa  367  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1054  esterase/lipase  66.79 
 
 		 271 aa  367  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0969  thermostable monoacylglycerol lipase  66.79 
 
 		 273 aa  367  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3077  esterase/lipase-like  65.68 
 
 		 271 aa  362  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5069  esterase/lipase-like  66.17 
 
 		 271 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5791  esterase/lipase-like protein  66.17 
 
 		 271 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4387  esterase/lipase-like protein  66.17 
 
 		 271 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0604  esterase/lipase-like protein  58.65 
 
 		 407 aa  317  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163166  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4661  Alpha/beta hydrolase fold  49.62 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0346  carboxylesterase  30.74 
 
 		 265 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154149  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0032  carboxylesterase  30.65 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.436632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0130  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513647 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5564  hypothetical protein  32.95 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1188  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1174  hypothetical protein  33.73 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5263  hypothetical protein  34.21 
 
 		 303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0035  hypothetical protein  32.03 
 
 		 292 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0952  hypothetical protein  28.52 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.600635  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5529  carboxylesterase  32.69 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08180  carboxylesterase  30.04 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4327  alpha/beta hydrolase fold  34.6 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259256  normal  0.0593909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1037  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  29.6 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  26 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3674  carboxylesterase  25.29 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000231487  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  25.9 
 
 		 253 aa  86.3  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4809  carboxylesterase  24.9 
 
 		 247 aa  85.9  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4957  carboxylesterase  24.9 
 
 		 247 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000198319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5335  carboxylesterase  24.9 
 
 		 246 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00681619  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  29.76 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5233  carboxylesterase  24.9 
 
 		 246 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0438362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4819  carboxylesterase  24.9 
 
 		 247 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000134966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5279  carboxylesterase  24.9 
 
 		 247 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5215  carboxylesterase  24.9 
 
 		 247 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  26.27 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  23.05 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0187  carboxylesterase, putative  26.48 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4922  carboxylesterase  24.42 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00817956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5244  carboxylesterase  24.51 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.239449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3126  carboxylesterase  23.44 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5708  carboxylesterase  24.51 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00884556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  29.8 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2956  carboxylesterase  25.97 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000116225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  28.93 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3124  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  25.86 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1550  putative esterase/lipase  26.88 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00836288  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  27.71 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2086  lysophospholipase L2, putative  29.25 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2227  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1939  lysophospholipase L2, putative  29.01 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  24.81 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2449  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3541  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  34.68 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2473  alpha/beta hydrolase fold  24.52 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0084305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2855  Esterase/lipase-like protein  25.95 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3609  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3458  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.37 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894454  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1551  putative esterase/lipase  28.17 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38652  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1086  alpha/beta hydrolase fold protein  26 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0205  carboxylesterase precursor  25.6 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0953521  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2553  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  26.07 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3567  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  hitchhiker  0.00484943 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2012  putative esterase/lipase  22.49 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  36.26 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1336  putative carboxylesterase  33.56 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.571303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1828  acylglycerol lipase  25.48 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  30.53 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16110  esterase/lipase  27.44 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0607403  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0479  hypothetical protein  30.84 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000116996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0492  hypothetical protein  30.84 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000195032  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  33.68 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4293  carboxylesterase  32.5 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  hitchhiker  0.0000139883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  32.65 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2760  Esterase/lipase  39.02 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  35.63 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0804  esterase/lipase-like protein  31.63 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00548514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0820  carboxyesterase precursor-like protein  31.63 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0090  carboxylesterase, putative  31.78 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0449  carboxylesterase  30 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3116  putative lipoprotein  35.04 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  39.78 
 
 		 733 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  31.76 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  26 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1552  putative esterase/lipase  25.1 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.431751 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  25.78 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1813  putative carboxylesterase  28.91 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0730  alpha/beta hydrolase fold  41.18 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0153643  normal  0.402092 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>