More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3320 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3320  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 		 376 aa  746    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4344  8-amino-7-oxononanoate synthase  74.47 
 
 		 376 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.104104 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  75 
 
 		 377 aa  541  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2421  8-amino-7-oxononanoate synthase  71.28 
 
 		 378 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.961626  normal  0.0795977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4240  8-amino-7-oxononanoate synthase  73.94 
 
 		 408 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.609227 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0718  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.03 
 
 		 382 aa  422  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2099  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.89 
 
 		 384 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.851935  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1473  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.38 
 
 		 379 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.928571  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2777  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.75 
 
 		 388 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.773541  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2822  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.37 
 
 		 382 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2918  8-amino-7-oxononanoate synthase  61.9 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1254  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.17 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0429  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.75 
 
 		 378 aa  349  4e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442423  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0491  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.75 
 
 		 378 aa  349  5e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2917  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.29 
 
 		 371 aa  322  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177659  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.32 
 
 		 396 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.71 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.22 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.46 
 
 		 389 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.7 
 
 		 390 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2998  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.01 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0168149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.74 
 
 		 394 aa  222  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2978  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.77 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.748921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5561  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.62 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.88 
 
 		 389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2069  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.5 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.45 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.73 
 
 		 399 aa  216  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.73 
 
 		 390 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.06 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1911  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.08 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.21 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.8 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.09 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.97 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.54 
 
 		 387 aa  209  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06645  probable 8-amino-7-oxononanoate synthase (Eurofung)  39.16 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3452  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.63 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427892  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0814  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.09 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0079  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.02 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2457  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.19 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3534  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.95 
 
 		 398 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0710  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.21 
 
 		 401 aa  206  7e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0628  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.21 
 
 		 401 aa  206  7e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.95 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3602  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.95 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.23 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.94 
 
 		 390 aa  202  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.53 
 
 		 391 aa  203  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.68 
 
 		 395 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.68 
 
 		 395 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.68 
 
 		 395 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.68 
 
 		 395 aa  202  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.68 
 
 		 395 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  40 
 
 		 396 aa  202  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.68 
 
 		 395 aa  202  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.77 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2838  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.5 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2775  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.22 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358245  normal  0.0206135 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.42 
 
 		 386 aa  199  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.83 
 
 		 391 aa  199  7e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.97 
 
 		 381 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0816  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.63 
 
 		 383 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.497874  normal  0.203864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.39 
 
 		 396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0613  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.99 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2429  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.11 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.53 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.15 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02875  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.39 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0113  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.15 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.74 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0142  8-amino-7-oxononanoate synthase  41 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0560736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0857  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.35 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0484111 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.2 
 
 		 384 aa  196  5.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.72 
 
 		 381 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05380  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  34.59 
 
 		 381 aa  196  8.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0461719  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3628  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.15 
 
 		 380 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.398519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3094  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.75 
 
 		 382 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.607978  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.9 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  32.35 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3077  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.75 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3137  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.75 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1923  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.75 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00136658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.16 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1470  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.34 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.000728084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1867  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.16 
 
 		 400 aa  192  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0183608  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2728  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.06 
 
 		 464 aa  192  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1802  aminotransferase class I and II  37.68 
 
 		 397 aa  192  9e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2344  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.41 
 
 		 403 aa  192  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1832  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.56 
 
 		 405 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0243  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.88 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0419  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.88 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6357  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.89 
 
 		 379 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1489  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.47 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1096  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.24 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.177322  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.44 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1476  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.49 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1195  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.4 
 
 		 382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.760383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0969  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.07 
 
 		 418 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211572  normal  0.251268 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1973  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.9 
 
 		 544 aa  190  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>