35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2768 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2768  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2974  hypothetical protein  78.45 
 
 		 181 aa  293  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.328088 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2948  hypothetical protein  55.31 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0326  hypothetical protein  56.25 
 
 		 178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.663922  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1971  hypothetical protein  55.68 
 
 		 178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3484  hypothetical protein  56.04 
 
 		 182 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2627  hypothetical protein  54.19 
 
 		 199 aa  190  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2321  hypothetical protein  46.98 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1821  hypothetical protein  46.11 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1172  hypothetical protein  45.35 
 
 		 174 aa  154  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423417  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1129  hypothetical protein  41.44 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3387  hypothetical protein  38.82 
 
 		 184 aa  117  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2703  hypothetical protein  35.03 
 
 		 171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0159  hypothetical protein  37.5 
 
 		 171 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1183  hypothetical protein  33.92 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.332216  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1761  hypothetical protein  36.71 
 
 		 96 aa  57.4  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0310951  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  30.99 
 
 		 79 aa  52  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  30.49 
 
 		 188 aa  52  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  32.11 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 309 aa  48.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  33.8 
 
 		 254 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 429 aa  45.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  25.56 
 
 		 251 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  29.58 
 
 		 254 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 254 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  29.58 
 
 		 254 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  29.58 
 
 		 254 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  29.58 
 
 		 254 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  29.58 
 
 		 254 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  29.58 
 
 		 254 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  29.58 
 
 		 254 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1898  hypothetical protein  29.58 
 
 		 254 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00577202  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  29.58 
 
 		 254 aa  42  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 216 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6202  hypothetical protein  34.78 
 
 		 171 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>