25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2288 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2288  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  1010    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.331255  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2132  hypothetical protein  99.8 
 
 		 534 aa  1005    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.509777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0424  hypothetical protein  47.25 
 
 		 473 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.469457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2999  hypothetical protein  45.15 
 
 		 474 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.572214  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2438  hypothetical protein  29.54 
 
 		 492 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4509  hypothetical protein  27.73 
 
 		 529 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353778 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87049  predicted protein  24.07 
 
 		 704 aa  106  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0290903  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03582  conserved hypothetical protein  22.19 
 
 		 1229 aa  87  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406645  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09466  conserved hypothetical protein  24.49 
 
 		 562 aa  77  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.014113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00770  plasma membrane protein, putative  24.79 
 
 		 692 aa  76.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867124  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1866  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  41.49 
 
 		 114 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.892343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  26.52 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05776  WW domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G06520)  24.14 
 
 		 1208 aa  60.1  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  25.79 
 
 		 542 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  22.69 
 
 		 702 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  26.76 
 
 		 590 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  26.91 
 
 		 540 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  25.96 
 
 		 577 aa  47.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  28.57 
 
 		 548 aa  47  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  23.36 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  31.01 
 
 		 531 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  25.28 
 
 		 550 aa  43.9  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  31.62 
 
 		 540 aa  43.9  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  31.91 
 
 		 520 aa  43.1  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  29.6 
 
 		 527 aa  43.5  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>