15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2277 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2277  DEAD/DEAH box helicase-like protein  100 
 
 		 197 aa  403  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.790294  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2125  hypothetical protein  99.49 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  82.54 
 
 		 751 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  54.59 
 
 		 746 aa  197  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.57 
 
 		 755 aa  154  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 739 aa  92  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.63 
 
 		 736 aa  62.4  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5141  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.86 
 
 		 740 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268323  normal  0.0636547 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.8 
 
 		 783 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.15 
 
 		 743 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  28.45 
 
 		 736 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0326  ATP-dependent helicase  25 
 
 		 734 aa  51.6  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.86 
 
 		 738 aa  52  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0141  DEAD/DEAH box helicase  23.08 
 
 		 743 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  19.53 
 
 		 734 aa  42.4  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>