41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2139 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  100 
 
 		 302 aa  620  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  88.74 
 
 		 301 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  89.74 
 
 		 301 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  81.52 
 
 		 302 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1751  putative 2Fe-2S ferredoxin protein  61.86 
 
 		 122 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0216484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0397  ferredoxin  61.86 
 
 		 122 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.449026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1188  ferredoxin  64.71 
 
 		 124 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000641343 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2499  ferredoxin  61.02 
 
 		 122 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.809791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2342  ferredoxin  60 
 
 		 115 aa  149  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0232  ferredoxin, 2Fe-2S  59.32 
 
 		 122 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1519  ferredoxin  60 
 
 		 114 aa  142  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0937354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1237  ferredoxin  60 
 
 		 114 aa  142  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0193309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3778  ferredoxin  55.08 
 
 		 122 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3149  ferredoxin  54.24 
 
 		 154 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0287  ferredoxin  55.17 
 
 		 121 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1916  ferredoxin  55.08 
 
 		 127 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39700  Ferredoxin  50.85 
 
 		 122 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3779  rubrerythrin  43.15 
 
 		 163 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2138  hypothetical protein  43.15 
 
 		 162 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942475  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1839  hypothetical protein  41.78 
 
 		 162 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2009  hypothetical protein  41.78 
 
 		 162 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3445  hypothetical protein  41.78 
 
 		 162 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35818  normal  0.0368438 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2337  hypothetical protein  42.47 
 
 		 159 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0286  rubrerythrin  39.6 
 
 		 174 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10400  hypothetical protein  41.22 
 
 		 155 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0545  ferredoxin  47.41 
 
 		 118 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1449  ferredoxin  53.39 
 
 		 120 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10560  ferritin-like protein  43.92 
 
 		 152 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.639396  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2723  rubrerythrin  38.19 
 
 		 167 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0811811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0478  hypothetical protein  33.78 
 
 		 151 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2957  Rubrerythrin  30.67 
 
 		 179 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0695  rubrerythrin  36.43 
 
 		 170 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289242  normal  0.0810169 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1530  rubrerythrin  32.24 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1236  ferredoxin  32.46 
 
 		 114 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0203128 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1518  ferredoxin, putative  32.46 
 
 		 114 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0846747  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2863  rubrerythrin  32.62 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6006  hypothetical protein  30.82 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00787853 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  31.17 
 
 		 164 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2861  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  42.11 
 
 		 351 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.771556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2722  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.24 
 
 		 354 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  30.4 
 
 		 119 aa  43.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>