18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1901 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1901  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1680  hypothetical protein  60.57 
 
 		 281 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3613  hypothetical protein  58.04 
 
 		 304 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2429  hypothetical protein  45.99 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4788  hypothetical protein  36.71 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3245  hypothetical protein  56.92 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  27.27 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  25.16 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.34 
 
 		 1888 aa  59.3  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  29.82 
 
 		 356 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  23.93 
 
 		 314 aa  52.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.77 
 
 		 2449 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  26.05 
 
 		 356 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  28.57 
 
 		 379 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  28.57 
 
 		 472 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  29.66 
 
 		 3472 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  26.73 
 
 		 356 aa  42.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  29.67 
 
 		 464 aa  42.4  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>