39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2269 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2269  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  360  9e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3552  hypothetical protein  82.63 
 
 		 192 aa  276  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.333315 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3259  hypothetical protein  49.72 
 
 		 198 aa  141  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0503  hypothetical protein  42.7 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2986  transmembrane protein  42.68 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03310  hypothetical protein  36.55 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3990  transmembrane protein  40.45 
 
 		 212 aa  110  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29118  normal  0.555253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1719  hypothetical protein  44.59 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.231903 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1001  conserved hypothetical membrane spanning protein  37.5 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2195  hypothetical protein  37.58 
 
 		 196 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0955  hypothetical protein  37.89 
 
 		 220 aa  94.7  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4502  hypothetical protein  38.65 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10588  hypothetical protein  31.35 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3255  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  86.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0734  hypothetical protein  35.78 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1460  hypothetical protein  29.41 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00443497  normal  0.661074 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1250  hypothetical protein  32.47 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649239  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1028  hypothetical protein  32.47 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1091  hypothetical protein  31.82 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1869  hypothetical protein  31.82 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.369698  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1258  hypothetical protein  31.82 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0374  hypothetical protein  31.82 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0776  hypothetical protein  31.82 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.186412  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2051  putative transmembrane protein  32.14 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.754982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1299  hypothetical protein  28.11 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0952657  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5971  putative transmembrane protein  28.98 
 
 		 249 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4158  putative transmembrane protein  27.75 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2304  hypothetical protein  29.79 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1314  putative transmembrane protein  29.28 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.19046 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3969  hypothetical protein  33.09 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.399927  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1669  hypothetical protein  29.79 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2281  hypothetical protein  29.79 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5608  hypothetical protein  30.5 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3246  putative transmembrane protein  29.28 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0997  hypothetical protein  30.5 
 
 		 205 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2197  hypothetical protein  30.5 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2319  hypothetical protein  30.5 
 
 		 205 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0586  hypothetical protein  26.82 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0474  putative transmembrane protein  28.42 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>