37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0694 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0694    100 
 
 
395 bp  783    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  92.89 
 
 
826 bp  531  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  92.89 
 
 
826 bp  531  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1220    94.22 
 
 
1955 bp  494  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000904356  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  91.78 
 
 
826 bp  494  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  91.51 
 
 
825 bp  486  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2051    90.7 
 
 
827 bp  474  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.294544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4423    90.79 
 
 
818 bp  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.227705  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0675    90.55 
 
 
876 bp  462  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0351205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  90.1 
 
 
826 bp  452  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  89.84 
 
 
826 bp  444  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  89.79 
 
 
826 bp  440  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4297    89.58 
 
 
825 bp  436  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  89.53 
 
 
826 bp  432  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  88.8 
 
 
826 bp  412  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  86.88 
 
 
814 bp  355  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2629    87.93 
 
 
823 bp  345  5.999999999999999e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4369    89.79 
 
 
287 bp  317  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0407016  normal  0.373385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1437    84.99 
 
 
808 bp  315  4.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0891    89.34 
 
 
807 bp  303  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000765218  unclonable  0.0000148237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0102    87.34 
 
 
244 bp  77.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000409194  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 
801 bp  50.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 
801 bp  50.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5115    96.55 
 
 
3897 bp  50.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 
801 bp  50.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 
801 bp  50.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 
801 bp  50.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 
801 bp  50.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 
801 bp  50.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 
801 bp  50.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 
801 bp  50.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 
801 bp  50.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 
801 bp  50.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 
801 bp  50.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0604    96.55 
 
 
1752 bp  50.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 
801 bp  50.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 
801 bp  50.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.167479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>