39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5747 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5747  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  223  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.970267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5372  hypothetical protein  49.51 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0256  hypothetical protein  61.36 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2058  putative signal peptide protein  35.14 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1976  hypothetical protein  50.56 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198719  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  36.04 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2095  hypothetical protein  48.6 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1965  hypothetical protein  47.66 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2082  hypothetical protein  45.61 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2063  hypothetical protein  45.61 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227781  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6014  hypothetical protein  45.61 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.810245  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1213  hypothetical protein  42.11 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.43875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4672  hypothetical protein  47.54 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951454  hitchhiker  0.00900362 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4777  hypothetical protein  52.5 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.18704 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2211  putative signal peptide protein  29.73 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1508  hypothetical protein  58.33 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.620222  hitchhiker  0.000360892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1151  hypothetical protein  46.94 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0417959  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1631  hypothetical protein  46.94 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2495  hypothetical protein  51.16 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1721  hypothetical protein  56.67 
 
 		 93 aa  44.3  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169601  hitchhiker  0.0000197195 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1606  hypothetical protein  44 
 
 		 83 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133632  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3241  hypothetical protein  76.19 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3767  hypothetical protein  76.19 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00933749  hitchhiker  0.00116407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1607  hypothetical protein  52.5 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00747509 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2503  hypothetical protein  55.26 
 
 		 115 aa  42.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00769616  hitchhiker  0.00377548 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1532  hypothetical protein  55 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1052  hypothetical protein  55 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1634  hypothetical protein  53.85 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101283  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2446  signal peptide protein  50 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  44.07 
 
 		 2750 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1528  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0603  hypothetical protein  73.68 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2910  signal peptide protein  44.64 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0237846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3202  hypothetical protein  53.16 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152158  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2549  hypothetical protein  53.16 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1385  hypothetical protein  53.16 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0245118  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2112  hypothetical protein  53.16 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2637  hypothetical protein  53.16 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1609  hypothetical protein  53.16 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0210429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>