47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5256 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5256  putative flagellar protein FliT  100 
 
 		 114 aa  230  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5093  flagellar protein FliT  42.73 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0385  flagellar protein FliT  33.63 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3670  flagellar protein FliT  31.86 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643949  normal  0.821667 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4747  putative flagellar protein FliT  31.86 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.408466 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2031  hypothetical protein  33.64 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.29372  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3767  putative flagellar protein FliT  34.58 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.684453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2773  flagellar export chaperone  31.73 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.804206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3139  hypothetical protein  31.73 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529843  normal  0.437682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0169  putative flagellar protein FliT  34.58 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24270  flagellar protein  33.02 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3058  hypothetical protein  35.42 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2972  hypothetical protein  34.69 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.124393 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2124  flagellar biosynthesis protein FliT  27.1 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110928  hitchhiker  0.00000066178 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2177  flagellar biosynthesis protein FliT  27.1 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.0161176 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1281  flagellar biosynthesis protein FliT  27.1 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000909072  normal  0.322252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2119  flagellar biosynthesis protein FliT  27.1 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136098  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1158  flagellar biosynthesis protein FliT  27.1 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0236782  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1341  flagellar protein FliT  34.26 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0498438  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3106  hypothetical protein  35.71 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1538  flagellar export chaperone  30 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472804  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2384  flagellar biosynthesis protein FliT  32.32 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2285  flagellar biosynthesis protein FliT  32.32 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2897  hypothetical protein  30.91 
 
 		 122 aa  52  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3397  hypothetical protein  35.63 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0237  hypothetical protein  35.63 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0225  hypothetical protein  35.63 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2139  hypothetical protein  35.63 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2949  hypothetical protein  35.63 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0203  hypothetical protein  35.63 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3284  hypothetical protein  35.63 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6410  hypothetical protein  33.67 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2863  flagellar chaperone  32.26 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2573  flagellar biosynthesis protein FliT  26.85 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.694894  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3080  hypothetical protein  33.67 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3061  hypothetical protein  33.67 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151059  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2447  hypothetical protein  33.67 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1893  flagellar biosynthesis protein FliT  28.44 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2928  putative flagellar protein FliT  27.84 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2525  flagellar biosynthesis protein FliT  26.8 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1013  flagellar chaperone  29.9 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1578  flagellar export chaperone  26.26 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2943  flagellar biosynthesis protein FliT  29.79 
 
 		 122 aa  42.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1594  flagellar protein FliT  32.35 
 
 		 109 aa  42.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0621  flagellar protein FliT  25 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2701  flagellar biosynthesis protein FliT  24.77 
 
 		 121 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1720  flagellar export chaperone  24.77 
 
 		 121 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.918748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>