More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1100 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 472 aa  966    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  57.7 
 
 		 459 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  56.37 
 
 		 468 aa  495  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 		 462 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 		 461 aa  480  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1404  cysteinyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 449 aa  480  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 474 aa  475  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0676  cysteinyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 		 474 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.02633 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0311  cysteinyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 467 aa  456  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2731  cysteinyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 459 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 485 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1153  cysteinyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.102155  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 456 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 459 aa  413  1e-114  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 459 aa  415  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1380  cysteinyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 486 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.461821 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 456 aa  408  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3498  cysteinyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2071  cysteinyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 486 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0459  cysteinyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0171748 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1638  cysteinyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 460 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2661  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 465 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 485 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 493 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 457 aa  398  1e-109  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 485 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 479 aa  395  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 487 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 493 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 459 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5212  cysteinyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.253411 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 485 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1958  cysteinyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.773483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5285  cysteinyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.693404  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4745  cysteinyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 459 aa  392  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3374  cysteinyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 493 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301866  normal  0.0269367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 461 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 461 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 461 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 490 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 494 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 459 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 474 aa  386  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  44.91 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 499 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2208  cysteinyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 491 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 459 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 463 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680985  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 488 aa  385  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 459 aa  388  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 459 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 460 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 488 aa  385  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1488  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 482 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4063  cysteinyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 462 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5571  cysteinyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0713  cysteinyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 461 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0121  cysteinyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 462 aa  379  1e-104  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.179815  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 478 aa  381  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2221  cysteinyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 462 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.312209  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 454 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 461 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>