23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0075 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0075  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0104  putative signal peptide protein  55.95 
 
 		 258 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0165  Sporulation domain protein  42.13 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.708881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0172  Sporulation domain protein  39.02 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0310  putative signal peptide protein  35.39 
 
 		 272 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2079  hypothetical protein  37.01 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3966  putative signal peptide protein  30.09 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3174  putative signal peptide protein  30.7 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.56163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2631  hypothetical protein  38.57 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3655  Sporulation domain protein  35.14 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4228  hypothetical protein  47.3 
 
 		 79 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.198207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4717  putative signal peptide protein  28.24 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0488  hypothetical protein  47.3 
 
 		 79 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0326515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0818  hypothetical protein  32.87 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349242  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3710  hypothetical protein  36.49 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3924  sporulation domain-containing protein  26.29 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08640  hypothetical protein  32 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000854998  hitchhiker  0.000197864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0202  hypothetical protein  49.12 
 
 		 79 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3342  Sporulation domain protein  30.77 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.796684  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3993  sporulation domain-containing protein  29.94 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.176394 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0917  hypothetical protein  27.34 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000260853  hitchhiker  0.00000167824 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2401  sporulation domain-containing protein  26.92 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0881  sporulation domain-containing protein  32.32 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>