25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1888 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1888  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  239  7e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1155  hypothetical protein  41.74 
 
 		 116 aa  93.6  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  40.68 
 
 		 119 aa  88.6  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0279  hypothetical protein  40.17 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.457399  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2515  hypothetical protein  33.63 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172015  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6320  hypothetical protein  35 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0428  hypothetical protein  34.48 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0537  hypothetical protein  31.86 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  35.71 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0170  hypothetical protein  30.25 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  31.67 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0696  hypothetical protein  31.78 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0776606  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  39.39 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5532  hypothetical protein  26.32 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  31.31 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0675  hypothetical protein  34.57 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.351726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0387  hypothetical protein  29.66 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2989  hypothetical protein  35.11 
 
 		 111 aa  42.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1354  hypothetical protein  32.35 
 
 		 133 aa  42  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.002337  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1941  hypothetical protein  40.3 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1363  hypothetical protein  33.75 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2777  hypothetical protein  29.41 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  30.95 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5309  hypothetical protein  33.77 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>