21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1862 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1862  hypothetical protein  100 
 
 		 829 aa  1610    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499944  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  37.78 
 
 		 741 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  34 
 
 		 668 aa  57.8  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  38.33 
 
 		 475 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  37.5 
 
 		 966 aa  54.3  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  34.41 
 
 		 468 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.93 
 
 		 1092 aa  48.1  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  29.23 
 
 		 152 aa  48.1  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  26.57 
 
 		 520 aa  47.8  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  37.78 
 
 		 525 aa  47.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  38.37 
 
 		 990 aa  47.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  34.52 
 
 		 1061 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  34.83 
 
 		 676 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  37.78 
 
 		 1162 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  35.71 
 
 		 554 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  40.91 
 
 		 468 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  40.45 
 
 		 615 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  34.96 
 
 		 763 aa  45.8  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  36.67 
 
 		 430 aa  45.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  35.56 
 
 		 516 aa  45.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  38.27 
 
 		 844 aa  44.3  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>