30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6583 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6583  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0167572 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5647  hypothetical protein  95.95 
 
 		 346 aa  693    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3314  hypothetical protein  89.31 
 
 		 346 aa  658    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5963  hypothetical protein  68.59 
 
 		 356 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0133958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0172  hypothetical protein  64.67 
 
 		 359 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3180  hypothetical protein  64.84 
 
 		 353 aa  484  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0794119 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3609  hypothetical protein  66.27 
 
 		 351 aa  475  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0442  hypothetical protein  61.05 
 
 		 347 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.773186  normal  0.498356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3455  hypothetical protein  62.43 
 
 		 338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2624  hypothetical protein  47.96 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3957  hypothetical protein  47.02 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4811  hypothetical protein  45.45 
 
 		 509 aa  285  5.999999999999999e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4809  hypothetical protein  35.9 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1933  hypothetical protein  34.84 
 
 		 315 aa  162  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0865  hypothetical protein  30.18 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149678  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2373  hypothetical protein  27.96 
 
 		 277 aa  90.1  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.780388  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2574  hypothetical protein  25.26 
 
 		 300 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00867  conserved hypothetical protein  27.41 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5139  hypothetical protein  23.72 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30337  conserved hypothetical protein  23.53 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.18618 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10123  conserved hypothetical protein  24.14 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32780  predicted protein  23.72 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04673  conserved hypothetical protein  24.7 
 
 		 489 aa  69.3  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1017  hypothetical protein  27.55 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00283953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1963  hypothetical protein  27.07 
 
 		 317 aa  67  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.435918  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58975  predicted protein  22.91 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.790136  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1780  hypothetical protein  26.25 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443384  normal  0.229108 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04122  conserved hypothetical protein  25.73 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.717308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2221  hypothetical protein  25.41 
 
 		 291 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.853189  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1054  hypothetical protein  33.04 
 
 		 145 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.657724  normal  0.456206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>