32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5900 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5900  hypothetical protein  100 
 
 
792 aa  1598    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4461  hypothetical protein  33.37 
 
 
858 aa  314  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  30.4 
 
 
869 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3821  hypothetical protein  29.42 
 
 
870 aa  308  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0310113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0098  hypothetical protein  30.79 
 
 
872 aa  298  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1489  hypothetical protein  32.81 
 
 
858 aa  297  7e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1466  hypothetical protein  32.81 
 
 
858 aa  297  7e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.467243  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0748  hypothetical protein  30.8 
 
 
855 aa  282  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.298605  normal  0.440798 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2658  hypothetical protein  31.38 
 
 
839 aa  270  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000653199  hitchhiker  0.00786959 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5574  hypothetical protein  30.83 
 
 
844 aa  266  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218076  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5977  hypothetical protein  30.83 
 
 
844 aa  266  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3110  hypothetical protein  28.49 
 
 
611 aa  189  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.464764  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  24.9 
 
 
795 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  23.33 
 
 
712 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  27.89 
 
 
847 aa  77  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  27.89 
 
 
847 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  24.69 
 
 
829 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0523  hypothetical protein  23.94 
 
 
743 aa  62.4  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  25.23 
 
 
570 aa  54.7  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  22.44 
 
 
821 aa  54.3  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.61 
 
 
827 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3535  hypothetical protein  23.25 
 
 
850 aa  53.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.692569  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2858  hypothetical protein  24.43 
 
 
835 aa  52.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6419  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.94 
 
 
729 aa  50.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0229441  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1693  hypothetical protein  26.24 
 
 
830 aa  49.3  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349675  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4230  hypothetical protein  26.67 
 
 
789 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.828103  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3739  hypothetical protein  23.34 
 
 
740 aa  46.6  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5697  hypothetical protein  24.79 
 
 
737 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4253  hypothetical protein  24.5 
 
 
846 aa  46.6  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3853  hypothetical protein  25.98 
 
 
845 aa  45.8  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0085  hypothetical protein  24.42 
 
 
849 aa  45.8  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0321951  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4146  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 
729 aa  45.4  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0370543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>