43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5559 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5559  prevent-host-death family protein  100 
 
 
93 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199357  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6553  prevent-host-death family protein  94.57 
 
 
93 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00354401  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  63.22 
 
 
91 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2751  ATPase  57.47 
 
 
91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  60.44 
 
 
91 aa  110  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2253  prevent-host-death family protein  56.52 
 
 
93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00900408  normal  0.987551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1488  prevent-host-death family protein  55.91 
 
 
93 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0682  prevent-host-death family protein  45.35 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  47.67 
 
 
87 aa  88.2  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  46.51 
 
 
87 aa  85.9  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1789  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  40.91 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  44.44 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  38.64 
 
 
92 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  36.36 
 
 
99 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2740  prevent-host-death family protein  49.43 
 
 
87 aa  70.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  35.23 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  35.23 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  35.23 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  31.82 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5451  prevent-host-death family protein  41.03 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.125011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  35.8 
 
 
87 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1277  prevent-host-death protein  33.33 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1782  prevent-host-death family protein  36.14 
 
 
85 aa  50.1  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  27.59 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0850  hypothetical protein  34.94 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0758  hypothetical protein  34.94 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02186  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  34.94 
 
 
85 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0889095  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02601  hypothetical protein  34.94 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1262  prevent-host-death family protein  29.11 
 
 
105 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003261  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  33.73 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1972  prevent-host-death family protein  29.27 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4642  hypothetical protein  33.73 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2562  prevent-host-death family protein  34.94 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0835616  normal  0.0155053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1353  prevent-host-death family protein  31.82 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.906372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01562  Prevent-host-death protein  36.54 
 
 
58 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1747  prevent-host-death family protein  27.85 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0915  prevent-host-death protein  34 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.752928  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3171  prevent-host-death family protein  33.75 
 
 
85 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0240  prevent-host-death family protein  30.23 
 
 
83 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2696  prevent-host-death family protein  31.75 
 
 
89 aa  41.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752077  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  27.78 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0628  prevent-host-death family protein  30.49 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000258599  unclonable  0.0000000000739074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0648  prevent-host-death family protein  30.49 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000197099  unclonable  0.0000000000981851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>