46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4315 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  96.46 
 
 		 424 aa  795    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  76.06 
 
 		 426 aa  653    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  78.12 
 
 		 425 aa  649    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  863    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  63.37 
 
 		 417 aa  541  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  59.47 
 
 		 422 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  59.47 
 
 		 441 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  58.23 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  59.95 
 
 		 422 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  60.8 
 
 		 431 aa  488  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  59.67 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  59.8 
 
 		 422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  53.79 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  54.06 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  49.53 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  52.17 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  53.77 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  53.52 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  54.16 
 
 		 448 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  49.88 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  54.12 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  51.76 
 
 		 420 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  50.13 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  53.97 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  51.95 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  53.17 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  49.49 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  50.38 
 
 		 475 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  50.38 
 
 		 446 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  41.56 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  40.48 
 
 		 480 aa  257  3e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  41.47 
 
 		 486 aa  256  5e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  40.38 
 
 		 482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  39.61 
 
 		 441 aa  250  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  38.96 
 
 		 399 aa  229  8e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  39.67 
 
 		 429 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  39.38 
 
 		 407 aa  216  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  38.2 
 
 		 400 aa  209  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  36.55 
 
 		 410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0345  imelysin  23.91 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  33.73 
 
 		 356 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  26.42 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  21 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  22.77 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  21.33 
 
 		 387 aa  44.3  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  28.43 
 
 		 384 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>