More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1038 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1184  cysteinyl-tRNA synthetase  92.87 
 
 		 463 aa  875    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.257527  normal  0.696826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1038  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 463 aa  955    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0713  cysteinyl-tRNA synthetase  79.05 
 
 		 466 aa  762    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0965  cysteinyl-tRNA synthetase  65.66 
 
 		 506 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.910557  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1488  cysteinyl-tRNA synthetase  64.11 
 
 		 482 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1228  cysteinyl-tRNA synthetase  63.07 
 
 		 477 aa  596  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  68.47 
 
 		 588 aa  577  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  59.11 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680985  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  58.52 
 
 		 449 aa  529  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2208  cysteinyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 491 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3374  cysteinyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 		 493 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301866  normal  0.0269367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3498  cysteinyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0670  cysteinyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 506 aa  509  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.438078  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0677  cysteinyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 506 aa  508  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2611  cysteinyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 505 aa  505  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.536822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 		 462 aa  497  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5212  cysteinyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 		 462 aa  494  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.253411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5285  cysteinyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 		 462 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.693404  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2086  cysteinyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 488 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.634388  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4745  cysteinyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 462 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5571  cysteinyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 465 aa  484  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0481  cysteinyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 500 aa  478  1e-133  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0459  cysteinyl-tRNA synthetase  54.13 
 
 		 460 aa  478  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0171748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1638  cysteinyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 460 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2661  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 459 aa  430  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1153  cysteinyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 457 aa  428  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.102155  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0676  cysteinyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 474 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.02633 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1380  cysteinyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 486 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.461821 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1404  cysteinyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 449 aa  411  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2071  cysteinyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 486 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4063  cysteinyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 499 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1958  cysteinyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 453 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.773483 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 468 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 472 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 474 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0311  cysteinyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 467 aa  375  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 490 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 465 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 485 aa  365  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 481 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2731  cysteinyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 458 aa  362  6e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 466 aa  360  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 465 aa  360  3e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 479 aa  359  5e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 460 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 480 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 465 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 488 aa  354  1e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 459 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 459 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 485 aa  353  4e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 454 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 461 aa  352  7e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 461 aa  352  7e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 459 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 494 aa  352  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 460 aa  352  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 480 aa  351  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 459 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 460 aa  350  3e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 493 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 493 aa  349  6e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 460 aa  348  8e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 461 aa  348  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2510  cysteinyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 465 aa  348  9e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390951  hitchhiker  0.00182498 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 459 aa  348  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 461 aa  348  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 470 aa  347  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 459 aa  347  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 462 aa  347  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 460 aa  347  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 505 aa  346  4e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 459 aa  346  4e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 460 aa  346  5e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 461 aa  346  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 487 aa  345  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 461 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 461 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>