40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2940 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2940  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 		 100 aa  194  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764051  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1018  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  62.79 
 
 		 96 aa  95.9  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2402  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  61.63 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1159  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  55.56 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0690  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  54.44 
 
 		 97 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0753  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  55.81 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0721  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  55.81 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3096  putative signal peptide protein  48.39 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391422  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3389  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  49.4 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0798  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  53.49 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5531  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  49.46 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3566  hypothetical protein  56.36 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0915222  hitchhiker  0.0000394569 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2771  hypothetical protein  47.83 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3730  hypothetical protein  47.83 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.302117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3672  hypothetical protein  47.83 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27307  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1782  hypothetical protein  47.83 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.921586  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2721  hypothetical protein  47.83 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681129  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3233  hypothetical protein  47.83 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453275  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3254  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40.48 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3517  hypothetical protein  46.48 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2765  hypothetical protein  54.55 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0337  hypothetical protein  46.48 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3700  hypothetical protein  47.14 
 
 		 636 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0398  hypothetical protein  46.48 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2999  hypothetical protein  47.83 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0322  hypothetical protein  47.06 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0535747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0346  hypothetical protein  45.07 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0392  hypothetical protein  54.55 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2957  putative signal peptide protein  45.45 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.516221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3117  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  42.11 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235733  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3235  putative signal peptide protein  41.49 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2888  putative signal peptide protein  41.57 
 
 		 103 aa  48.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0100  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40.74 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000362736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  34.33 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  34.33 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  34.33 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0101  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  41.82 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2745  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.77 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2688  hypothetical protein  46.48 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0419  hypothetical protein  46.48 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>