21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1419 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1419  SlyX  100 
 
 		 72 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1372  hypothetical protein  63.77 
 
 		 78 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0062  SlyX family protein  56.16 
 
 		 73 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.918474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4054  SlyX family protein  52.7 
 
 		 74 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2515  SlyX family protein  56.06 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3168  SlyX family protein  56.06 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3859  SlyX family protein  66.2 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1564  SlyX family protein  53.03 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0713  SlyX family protein  50 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2830  SlyX family protein  51.52 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159899  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1134  SlyX family protein  43.08 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.830125  normal  0.0936794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2678  SlyX  45.45 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.4298  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5924  hypothetical protein  44.93 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1786  SlyX family protein  41.54 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2502  SlyX family protein  37.88 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  33.33 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1260  SlyX family protein  40 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  29.73 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1717  SlyX family protein  36.36 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000834662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3034  SlyX family protein  36.62 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3258  SlyX family protein  36.62 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>