31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3481 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3481  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.352755  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1600  hypothetical protein  36.98 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.400677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  30.49 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  28.57 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  30.14 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  23.96 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  30.48 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  35.96 
 
 		 257 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  32.67 
 
 		 230 aa  53.1  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  33.59 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  28.49 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  30.11 
 
 		 278 aa  49.3  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  28.57 
 
 		 234 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  28.16 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  29.71 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  28.15 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  25.54 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  27.08 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  31.25 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  29.82 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  29.58 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  29.79 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  28.07 
 
 		 229 aa  43.5  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  27.69 
 
 		 240 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  27.01 
 
 		 232 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  25.99 
 
 		 219 aa  43.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  27.69 
 
 		 240 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  30.28 
 
 		 268 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  27.69 
 
 		 240 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  27.69 
 
 		 240 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  28.46 
 
 		 240 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>