32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2512 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2512  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  739    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3788  hypothetical protein  79.77 
 
 
350 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3930  hypothetical protein  77.26 
 
 
361 aa  559  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1850  hypothetical protein  75.51 
 
 
361 aa  547  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0216  hypothetical protein  75.45 
 
 
346 aa  534  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000223625  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4327  hypothetical protein  74.34 
 
 
346 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513809  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4550  hypothetical protein  73.76 
 
 
346 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.33073  normal  0.671741 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3486  hypothetical protein  73.76 
 
 
346 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698946 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4039  hypothetical protein  74.05 
 
 
346 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0438234  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4293  hypothetical protein  64.83 
 
 
347 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3945  hypothetical protein  54.55 
 
 
350 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.402122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3580  hypothetical protein  54.25 
 
 
350 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1892  hypothetical protein  54.55 
 
 
350 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2138  hypothetical protein  53.96 
 
 
350 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0606225 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2312  hypothetical protein  53.96 
 
 
352 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6046  hypothetical protein  45.13 
 
 
344 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1162  hypothetical protein  30.1 
 
 
324 aa  72  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.607054  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0213  hypothetical protein  29.9 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11100  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)  24.48 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3067  hypothetical protein  27.8 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2649  hypothetical protein  25.81 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2293  hypothetical protein  24.47 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.885941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0396  hypothetical protein  23.56 
 
 
338 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0394  hypothetical protein  26.57 
 
 
347 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1671  aminopeptidase (leucyl aminopeptidase, aminopeptidase T) 1  25.79 
 
 
316 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0343  hypothetical protein  25.65 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0528  aminopeptidase  25.81 
 
 
316 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2684  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  22.97 
 
 
313 aa  49.7  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2557  aminopeptidase  24.88 
 
 
317 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3010  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  23.61 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1947  hypothetical protein  26.14 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3281  hypothetical protein  26.37 
 
 
409 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.693559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>