More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3565 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.16 
 
 
291 aa  546  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.19 
 
 
292 aa  381  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.660216  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.09 
 
 
297 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.84 
 
 
301 aa  286  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.52 
 
 
302 aa  278  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.87 
 
 
302 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.54 
 
 
300 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.18 
 
 
307 aa  257  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.13 
 
 
296 aa  253  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.06 
 
 
305 aa  252  6e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00998336  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.43 
 
 
299 aa  249  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0352539  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.85 
 
 
299 aa  249  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050805  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.85 
 
 
299 aa  248  9e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.85 
 
 
299 aa  247  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.83 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000371485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.93 
 
 
280 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.57 
 
 
279 aa  235  7e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.88 
 
 
273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.15 
 
 
294 aa  228  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.16 
 
 
277 aa  227  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.34 
 
 
305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.74 
 
 
278 aa  224  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.74 
 
 
278 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.482027  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7346  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  43.26 
 
 
278 aa  222  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5582  ABC transporter membrane spanning protein (galacturonic acid)  43.75 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
301 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.64 
 
 
298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
295 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.46 
 
 
291 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0974901  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  45.26 
 
 
273 aa  207  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.28 
 
 
292 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.924355  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.28 
 
 
292 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000934569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.23 
 
 
381 aa  206  5e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
300 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.44 
 
 
273 aa  205  6e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.52 
 
 
285 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
315 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
273 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
272 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  42.65 
 
 
272 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1703  putative transport system permease ABC transporter protein  41.67 
 
 
292 aa  203  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.757038  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.3 
 
 
308 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
293 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
290 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  40.14 
 
 
277 aa  202  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
306 aa  201  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1688  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 
281 aa  200  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 
277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01230  ABC-type sugar transport system, permease component  40.91 
 
 
307 aa  199  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1314  ABC transporter, permease protein  42.42 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  41.57 
 
 
280 aa  195  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
279 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0806983  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  41.8 
 
 
291 aa  194  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
318 aa  194  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000451963  hitchhiker  0.00127985 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
280 aa  193  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.697078  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05240  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.43 
 
 
312 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
281 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 
297 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.807172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 
306 aa  193  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.250656  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
290 aa  192  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.72 
 
 
289 aa  192  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.858464 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29710  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.55 
 
 
304 aa  192  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.942295  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29340  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.92 
 
 
280 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27710  ABC-type sugar transport system, permease component  36.9 
 
 
309 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.935575  normal  0.331014 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  39.61 
 
 
277 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.59 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0303683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  39.19 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.32 
 
 
314 aa  188  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00328886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
274 aa  188  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
300 aa  188  9e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.46 
 
 
279 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
292 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
286 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
301 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00963253  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 
300 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.303793  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 
313 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 
324 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
278 aa  186  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.73 
 
 
274 aa  185  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330294  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  38.4 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
300 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
293 aa  183  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000740706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
271 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
285 aa  182  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.85 
 
 
302 aa  182  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
306 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429267  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1690  oligogalacturonide ABC tansporter, permease protein  37.32 
 
 
306 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.064753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2646  oligogalacturonide ABC tansporter, permease  37.32 
 
 
306 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.559892  normal  0.131938 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
308 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408611  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05440  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.25 
 
 
307 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.050978  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
295 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
284 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.02 
 
 
275 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
301 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 
285 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.866945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
276 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>