23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0409 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0409  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  167  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74354  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0161  protein of unknown function UPF0175  77.11 
 
 		 86 aa  135  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0647  hypothetical protein  78.31 
 
 		 86 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2349  hypothetical protein  51.47 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240227  normal  0.168126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1082  hypothetical protein  52.94 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109568  normal  0.721009 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5307  hypothetical protein  48.19 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.276905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0173  hypothetical protein  48.19 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.315978 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5352  protein of unknown function UPF0175  42.11 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4274  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1083  hypothetical protein  39.39 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1353  protein of unknown function UPF0175  45.31 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00774094  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0052  protein of unknown function UPF0175  39.76 
 
 		 82 aa  50.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0476842  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2613  protein of unknown function UPF0175  34.62 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2482  hypothetical protein  36.62 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4046  protein of unknown function UPF0175  35.14 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1012  protein of unknown function UPF0175  34.62 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2825  hypothetical protein  32.35 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00979605  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0312  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0101  protein of unknown function UPF0175  38.24 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1485  hypothetical protein  38.6 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152276  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1246  hypothetical protein  34.62 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0516  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1451  protein of unknown function UPF0175  38.6 
 
 		 84 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>