22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0177 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0177  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  289  7e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00894063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4580  hypothetical protein  77.55 
 
 		 148 aa  209  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00353723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0597  hypothetical protein  39.85 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6170  hypothetical protein  33.85 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2442  hypothetical protein  48.33 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.518051  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37700  hypothetical protein  33.78 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.251793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0459  hypothetical protein  33.08 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358018  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2309  hypothetical protein  47.46 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000360687 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4354  hypothetical protein  38.39 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.909208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0601  hypothetical protein  33.08 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4376  hypothetical protein  32.61 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1546  hypothetical protein  46.38 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0165489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0448  hypothetical protein  31.06 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.933593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5222  glutaredoxin/malate transporter fusion protein  30.14 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.897552 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0669  hypothetical protein  28.29 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1574  hypothetical protein  31.54 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4231  hypothetical protein  33.57 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0901  hypothetical protein  31.58 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2109  hypothetical protein  37.38 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6827  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4014  hypothetical protein  30.4 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.404496  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1525  hypothetical protein  27.82 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.135501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>