More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0555 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  100 
 
 		 401 aa  777    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  86.53 
 
 		 401 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  85.79 
 
 		 401 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  85.29 
 
 		 390 aa  643    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  88.89 
 
 		 390 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  87.01 
 
 		 390 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  77.1 
 
 		 397 aa  600  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  81.65 
 
 		 390 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  81.65 
 
 		 390 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  81.14 
 
 		 390 aa  594  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  77.35 
 
 		 394 aa  584  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  76.21 
 
 		 392 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  76.47 
 
 		 392 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  74.31 
 
 		 396 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  74.68 
 
 		 396 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  74.31 
 
 		 396 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  74.06 
 
 		 396 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  72.21 
 
 		 400 aa  495  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  68.85 
 
 		 398 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  67.59 
 
 		 399 aa  482  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  66.32 
 
 		 385 aa  479  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  64.29 
 
 		 393 aa  468  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  66.58 
 
 		 382 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  61.21 
 
 		 395 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  57.73 
 
 		 392 aa  418  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  76.19 
 
 		 188 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  76.19 
 
 		 188 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  74.73 
 
 		 187 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  74.73 
 
 		 187 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  37.3 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  34.87 
 
 		 382 aa  189  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.18 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.22 
 
 		 379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  32.21 
 
 		 389 aa  177  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.55 
 
 		 386 aa  173  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  29.86 
 
 		 442 aa  172  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.17 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.04 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.46 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.79 
 
 		 387 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  34.11 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  28.32 
 
 		 453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  30.3 
 
 		 393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  28.34 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  33.16 
 
 		 379 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  27.23 
 
 		 454 aa  159  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  28 
 
 		 376 aa  157  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  28.92 
 
 		 444 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.95 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  34.41 
 
 		 388 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  29.75 
 
 		 445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.58 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  28.63 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  30.7 
 
 		 456 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  30.77 
 
 		 376 aa  150  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  26.75 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  28.84 
 
 		 450 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  28.94 
 
 		 447 aa  143  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  28.95 
 
 		 443 aa  143  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  31.77 
 
 		 378 aa  143  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  28.3 
 
 		 450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  30.84 
 
 		 452 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  28.85 
 
 		 428 aa  139  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  29.69 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  27.85 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  29.3 
 
 		 428 aa  136  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  26.63 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.68 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  31.09 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  28.96 
 
 		 443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.64 
 
 		 441 aa  129  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  28.54 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  24.21 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  26.79 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  26.3 
 
 		 456 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  27.76 
 
 		 466 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.51 
 
 		 467 aa  126  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  27.81 
 
 		 449 aa  125  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2523  chromate transporter  25.06 
 
 		 471 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0153  chromate transporter  24.83 
 
 		 466 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.193683  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  31.52 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2724  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.46 
 
 		 473 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.63 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  28.13 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.25 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  25.61 
 
 		 462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.07 
 
 		 469 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1532  chromate transporter  27.09 
 
 		 452 aa  116  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.65 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2341  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.61 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1609  chromate transporter  34.38 
 
 		 398 aa  113  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  36.2 
 
 		 456 aa  113  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  26.74 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  28.31 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  28.47 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.68 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  26.46 
 
 		 432 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  29.51 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.13 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.38 
 
 		 465 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>