37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2001 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2001  signal peptide protein  100 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1832  signal peptide protein  79.01 
 
 		 180 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830252  normal  0.442369 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2156  putative signal peptide protein  77.71 
 
 		 184 aa  243  8e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2330  signal peptide protein  52.49 
 
 		 178 aa  177  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2491  putative signal peptide protein  50.82 
 
 		 183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4354  hypothetical protein  48.75 
 
 		 164 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2901  hypothetical protein  46.63 
 
 		 168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6861  hypothetical protein  55.93 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.603674  normal  0.19268 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1753  hypothetical protein  46.75 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0495  hypothetical protein  46.75 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1825  hypothetical protein  46.75 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1617  hypothetical protein  46.75 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0656  hypothetical protein  47.34 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945283  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0798  hypothetical protein  46.75 
 
 		 169 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2476  hypothetical protein  46.75 
 
 		 169 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2338  hypothetical protein  46.75 
 
 		 169 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4653  hypothetical protein  45.61 
 
 		 167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3823  hypothetical protein  45.45 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.371483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2156  hypothetical protein  44.31 
 
 		 171 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3307  hypothetical protein  44.85 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43876 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3930  hypothetical protein  44.91 
 
 		 171 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3598  hypothetical protein  44.91 
 
 		 171 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.621605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4437  hypothetical protein  44.91 
 
 		 171 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1066  hypothetical protein  40.66 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.478298  normal  0.0441936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0755  hypothetical protein  38.95 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1435  hypothetical protein  35.14 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2278  hypothetical protein  38.67 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2788  hypothetical protein  38.67 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.322714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3028  hypothetical protein  36 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0073  hypothetical protein  30 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491512  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1805  hypothetical protein  32.47 
 
 		 233 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0148188  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2209  hypothetical protein  35 
 
 		 236 aa  49.3  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2710  putative signal peptide protein  28.77 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.122349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2432  hypothetical protein  32.61 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0933223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4357  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3596  hypothetical protein  32.14 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1366  putative signal peptide protein  40 
 
 		 173 aa  42  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>