26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1066 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1066  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  256  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.478298  normal  0.0441936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0755  hypothetical protein  79.03 
 
 		 124 aa  216  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1832  signal peptide protein  42.57 
 
 		 180 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830252  normal  0.442369 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2156  putative signal peptide protein  42.71 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2491  putative signal peptide protein  42.39 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2001  signal peptide protein  40.66 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2330  signal peptide protein  43.37 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4354  hypothetical protein  42.17 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6861  hypothetical protein  39.76 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.603674  normal  0.19268 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1753  hypothetical protein  34.23 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0495  hypothetical protein  34.23 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1825  hypothetical protein  34.23 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1617  hypothetical protein  34.23 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2901  hypothetical protein  39.76 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2476  hypothetical protein  34.23 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2338  hypothetical protein  34.23 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0656  hypothetical protein  33.93 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945283  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0798  hypothetical protein  34.23 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3930  hypothetical protein  37.08 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3598  hypothetical protein  37.08 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.621605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4437  hypothetical protein  37.08 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2156  hypothetical protein  35.96 
 
 		 171 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4653  hypothetical protein  35.96 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3823  hypothetical protein  35.87 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.371483 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3307  hypothetical protein  35.96 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1435  hypothetical protein  39.44 
 
 		 183 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>