27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1435 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1435  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  366  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2278  hypothetical protein  44.78 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2788  hypothetical protein  44.78 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.322714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3028  hypothetical protein  60.18 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3596  hypothetical protein  60.18 
 
 		 207 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2432  hypothetical protein  57.52 
 
 		 196 aa  148  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0933223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2209  hypothetical protein  54.87 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1805  hypothetical protein  57.52 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0148188  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4357  hypothetical protein  44.87 
 
 		 220 aa  131  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1366  putative signal peptide protein  43.59 
 
 		 173 aa  100  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2710  putative signal peptide protein  46.88 
 
 		 146 aa  93.2  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.122349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2491  putative signal peptide protein  37.5 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2001  signal peptide protein  37.35 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2330  signal peptide protein  36.25 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2156  putative signal peptide protein  36.14 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1832  signal peptide protein  36.14 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830252  normal  0.442369 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1066  hypothetical protein  39.44 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.478298  normal  0.0441936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0755  hypothetical protein  38.03 
 
 		 124 aa  47.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0495  hypothetical protein  31.33 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1825  hypothetical protein  31.33 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1617  hypothetical protein  31.33 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0656  hypothetical protein  31.33 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945283  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1753  hypothetical protein  31.33 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2338  hypothetical protein  31.33 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2476  hypothetical protein  31.33 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0798  hypothetical protein  31.33 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4354  hypothetical protein  30.38 
 
 		 164 aa  41.2  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>