27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0755 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0755  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  258  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1066  hypothetical protein  79.03 
 
 
124 aa  216  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.478298  normal  0.0441936 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1832  signal peptide protein  43.48 
 
 
180 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830252  normal  0.442369 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2491  putative signal peptide protein  45.05 
 
 
183 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2156  putative signal peptide protein  44.83 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120946  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2330  signal peptide protein  42.17 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2001  signal peptide protein  39.56 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4354  hypothetical protein  40.91 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6861  hypothetical protein  39.76 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.603674  normal  0.19268 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2901  hypothetical protein  39.77 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1753  hypothetical protein  38.64 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0495  hypothetical protein  38.64 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1825  hypothetical protein  38.64 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1617  hypothetical protein  38.64 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2476  hypothetical protein  38.64 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2338  hypothetical protein  38.64 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0656  hypothetical protein  38.2 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945283  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0798  hypothetical protein  38.64 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4653  hypothetical protein  37.93 
 
 
167 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158228  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2156  hypothetical protein  36.78 
 
 
171 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3930  hypothetical protein  36.78 
 
 
171 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3598  hypothetical protein  36.78 
 
 
171 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.621605  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4437  hypothetical protein  36.78 
 
 
171 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3823  hypothetical protein  34.78 
 
 
169 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.371483 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3307  hypothetical protein  34.83 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.43876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1435  hypothetical protein  38.03 
 
 
183 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2432  hypothetical protein  27.5 
 
 
196 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0933223  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>