17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1366 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1366  putative signal peptide protein  100 
 
 		 173 aa  350  7e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2710  putative signal peptide protein  57.73 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.122349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1435  hypothetical protein  45.14 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2209  hypothetical protein  44.72 
 
 		 236 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2432  hypothetical protein  46.67 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0933223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3596  hypothetical protein  42.97 
 
 		 207 aa  101  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2788  hypothetical protein  48.96 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.322714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2278  hypothetical protein  48.96 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1805  hypothetical protein  42.15 
 
 		 233 aa  99  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0148188  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3028  hypothetical protein  42.45 
 
 		 223 aa  97.4  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4357  hypothetical protein  38.4 
 
 		 220 aa  90.9  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2491  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2330  signal peptide protein  35.56 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2156  putative signal peptide protein  28.89 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1832  signal peptide protein  27.78 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830252  normal  0.442369 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2001  signal peptide protein  28.74 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4354  hypothetical protein  35.71 
 
 		 164 aa  41.2  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>