31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3596 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3596  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  401  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3028  hypothetical protein  66.84 
 
 
223 aa  225  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134769  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2278  hypothetical protein  59.26 
 
 
206 aa  202  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2788  hypothetical protein  59.26 
 
 
206 aa  202  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.322714 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2209  hypothetical protein  61.31 
 
 
236 aa  201  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1805  hypothetical protein  61.39 
 
 
233 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0148188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2432  hypothetical protein  64.17 
 
 
196 aa  175  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0933223  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1435  hypothetical protein  50.57 
 
 
183 aa  165  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4357  hypothetical protein  54.97 
 
 
220 aa  157  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1366  putative signal peptide protein  43.8 
 
 
173 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2710  putative signal peptide protein  40.17 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.122349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2491  putative signal peptide protein  35.2 
 
 
183 aa  54.7  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2330  signal peptide protein  32.88 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2001  signal peptide protein  32.88 
 
 
185 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2901  hypothetical protein  35.62 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1617  hypothetical protein  33.75 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0656  hypothetical protein  33.75 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945283  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1825  hypothetical protein  33.75 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0495  hypothetical protein  33.75 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4354  hypothetical protein  34.25 
 
 
164 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1753  hypothetical protein  33.75 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0798  hypothetical protein  33.75 
 
 
169 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2476  hypothetical protein  33.75 
 
 
169 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2338  hypothetical protein  33.75 
 
 
169 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6861  hypothetical protein  35.06 
 
 
168 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.603674  normal  0.19268 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2156  hypothetical protein  36.36 
 
 
171 aa  42  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3930  hypothetical protein  36.36 
 
 
171 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3598  hypothetical protein  36.36 
 
 
171 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.621605  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3823  hypothetical protein  36.36 
 
 
169 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.371483 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4437  hypothetical protein  36.36 
 
 
171 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3307  hypothetical protein  36.36 
 
 
169 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.43876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>