33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2901 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2901  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  342  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4354  hypothetical protein  83.64 
 
 
164 aa  286  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6861  hypothetical protein  91.67 
 
 
168 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.603674  normal  0.19268 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1753  hypothetical protein  65.12 
 
 
169 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0495  hypothetical protein  65.12 
 
 
169 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1825  hypothetical protein  65.12 
 
 
169 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1617  hypothetical protein  65.12 
 
 
169 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0656  hypothetical protein  65.12 
 
 
169 aa  204  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945283  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2476  hypothetical protein  65.12 
 
 
169 aa  204  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2338  hypothetical protein  65.12 
 
 
169 aa  204  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0798  hypothetical protein  65.12 
 
 
169 aa  204  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2156  hypothetical protein  59.06 
 
 
171 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4653  hypothetical protein  58.72 
 
 
167 aa  185  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158228  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3823  hypothetical protein  59.88 
 
 
169 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.371483 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4437  hypothetical protein  57.89 
 
 
171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3307  hypothetical protein  59.88 
 
 
169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.43876 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3930  hypothetical protein  57.89 
 
 
171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3598  hypothetical protein  57.89 
 
 
171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.621605  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1832  signal peptide protein  46.63 
 
 
180 aa  131  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830252  normal  0.442369 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2001  signal peptide protein  46.01 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2156  putative signal peptide protein  58.51 
 
 
184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120946  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2330  signal peptide protein  42.33 
 
 
178 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2491  putative signal peptide protein  54.17 
 
 
183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1066  hypothetical protein  39.76 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.478298  normal  0.0441936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0755  hypothetical protein  39.77 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3028  hypothetical protein  34.12 
 
 
223 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134769  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0073  hypothetical protein  25.29 
 
 
134 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491512  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2209  hypothetical protein  35.62 
 
 
236 aa  47.8  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2788  hypothetical protein  32.89 
 
 
206 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.322714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2278  hypothetical protein  32.89 
 
 
206 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1435  hypothetical protein  28.97 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3596  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2710  putative signal peptide protein  29.67 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.122349 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>