31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3307 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3307  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  341  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3823  hypothetical protein  98.82 
 
 		 169 aa  338  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.371483 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4653  hypothetical protein  90.53 
 
 		 167 aa  291  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2156  hypothetical protein  91.23 
 
 		 171 aa  286  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3598  hypothetical protein  90.64 
 
 		 171 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.621605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4437  hypothetical protein  90.64 
 
 		 171 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3930  hypothetical protein  90.64 
 
 		 171 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0656  hypothetical protein  77.65 
 
 		 169 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945283  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0798  hypothetical protein  75.88 
 
 		 169 aa  239  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2338  hypothetical protein  75.88 
 
 		 169 aa  239  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2476  hypothetical protein  75.88 
 
 		 169 aa  239  9e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1753  hypothetical protein  75.88 
 
 		 169 aa  239  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0495  hypothetical protein  75.88 
 
 		 169 aa  239  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1825  hypothetical protein  75.88 
 
 		 169 aa  239  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1617  hypothetical protein  75.88 
 
 		 169 aa  239  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4354  hypothetical protein  65.87 
 
 		 164 aa  214  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2901  hypothetical protein  61.63 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6861  hypothetical protein  61.63 
 
 		 168 aa  185  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.603674  normal  0.19268 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2001  signal peptide protein  46.67 
 
 		 185 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2330  signal peptide protein  43.98 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1832  signal peptide protein  55.45 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830252  normal  0.442369 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2156  putative signal peptide protein  53.06 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2491  putative signal peptide protein  40.61 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1066  hypothetical protein  35.96 
 
 		 124 aa  60.5  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.478298  normal  0.0441936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0755  hypothetical protein  34.83 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2209  hypothetical protein  34.62 
 
 		 236 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2788  hypothetical protein  32.1 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.322714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2278  hypothetical protein  32.1 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3028  hypothetical protein  33.75 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2710  putative signal peptide protein  29.87 
 
 		 146 aa  42  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.122349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3596  hypothetical protein  36.36 
 
 		 207 aa  41.6  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>