32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0798 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2338  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  346  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0798  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  346  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2476  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  346  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1753  hypothetical protein  99.41 
 
 
169 aa  344  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0495  hypothetical protein  99.41 
 
 
169 aa  344  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1825  hypothetical protein  99.41 
 
 
169 aa  344  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1617  hypothetical protein  99.41 
 
 
169 aa  344  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0656  hypothetical protein  95.86 
 
 
169 aa  314  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945283  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4653  hypothetical protein  75.74 
 
 
167 aa  238  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158228  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4437  hypothetical protein  76.47 
 
 
171 aa  233  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3930  hypothetical protein  76.47 
 
 
171 aa  233  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3598  hypothetical protein  76.47 
 
 
171 aa  233  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.621605  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3823  hypothetical protein  75.88 
 
 
169 aa  228  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.371483 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3307  hypothetical protein  75.29 
 
 
169 aa  226  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.43876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2156  hypothetical protein  73.68 
 
 
171 aa  226  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4354  hypothetical protein  69.09 
 
 
164 aa  216  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2901  hypothetical protein  64.53 
 
 
168 aa  197  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6861  hypothetical protein  64.53 
 
 
168 aa  189  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.603674  normal  0.19268 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2001  signal peptide protein  58.42 
 
 
185 aa  121  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1832  signal peptide protein  57.43 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830252  normal  0.442369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2330  signal peptide protein  42.77 
 
 
178 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2156  putative signal peptide protein  55.1 
 
 
184 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120946  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2491  putative signal peptide protein  40.96 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1066  hypothetical protein  34.23 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.478298  normal  0.0441936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0755  hypothetical protein  38.64 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2209  hypothetical protein  33.75 
 
 
236 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3028  hypothetical protein  34.18 
 
 
223 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134769  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1435  hypothetical protein  31.33 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2788  hypothetical protein  31.25 
 
 
206 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.322714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0073  hypothetical protein  32.14 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491512  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2278  hypothetical protein  31.25 
 
 
206 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3596  hypothetical protein  33.75 
 
 
207 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>