20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0073 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0073  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  275  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491512  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1832  signal peptide protein  33.33 
 
 
180 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830252  normal  0.442369 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2156  putative signal peptide protein  32.1 
 
 
184 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120946  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4354  hypothetical protein  26.44 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2001  signal peptide protein  30 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2901  hypothetical protein  25.29 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6861  hypothetical protein  25.3 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.603674  normal  0.19268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2330  signal peptide protein  31.03 
 
 
178 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0656  hypothetical protein  33.93 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945283  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2491  putative signal peptide protein  28.4 
 
 
183 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2476  hypothetical protein  25.88 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0495  hypothetical protein  25.88 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2338  hypothetical protein  25.88 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1825  hypothetical protein  25.88 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1617  hypothetical protein  25.88 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0798  hypothetical protein  25.88 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1753  hypothetical protein  25.88 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2788  hypothetical protein  24.19 
 
 
206 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.322714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2278  hypothetical protein  24.19 
 
 
206 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2432  hypothetical protein  26.25 
 
 
196 aa  41.2  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0933223  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>