39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3361 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  100 
 
 
355 aa  731    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  93.95 
 
 
351 aa  677    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  45.63 
 
 
356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  45.63 
 
 
356 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  45.63 
 
 
356 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  46.88 
 
 
362 aa  318  6e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  44.72 
 
 
374 aa  312  5.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  45.56 
 
 
357 aa  311  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  44.76 
 
 
353 aa  311  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  44.16 
 
 
356 aa  310  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  43.99 
 
 
363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  44.88 
 
 
362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  43.56 
 
 
363 aa  309  5e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  42.62 
 
 
375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  45.28 
 
 
361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  42.49 
 
 
354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  43.96 
 
 
426 aa  302  6.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  43.61 
 
 
361 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  44.85 
 
 
364 aa  295  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  39.57 
 
 
370 aa  291  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  41.01 
 
 
365 aa  289  4e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  42.38 
 
 
363 aa  276  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  40.73 
 
 
356 aa  264  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  40.06 
 
 
357 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0839  hypothetical protein  44.61 
 
 
281 aa  237  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51863  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  38.04 
 
 
378 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  34.99 
 
 
347 aa  189  4e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  34.9 
 
 
382 aa  189  9e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  33.43 
 
 
380 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  41.38 
 
 
245 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  27.94 
 
 
395 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  32.18 
 
 
387 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0842  hypothetical protein  61.33 
 
 
85 aa  93.2  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  34.24 
 
 
360 aa  89  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  25.86 
 
 
394 aa  84  0.000000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  34.83 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  25 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  31.03 
 
 
375 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2571  protein of unknown function DUF450  27.68 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.280266  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>