84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3199 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3199  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), flavoprotein subunit  100 
 
 		 340 aa  624  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3938  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  97.65 
 
 		 340 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0505598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3199  hypothetical protein  75.22 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.539109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0011  Flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding  30.98 
 
 		 430 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.683974  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0032  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), flavoprotein subunit  31.16 
 
 		 430 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.067608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2996  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), flavoprotein subunit  27.84 
 
 		 426 aa  116  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1800  oxidoreductase, putative  30.5 
 
 		 408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2004  sulfide dehydrogenase, flavoprotein subunit  29.79 
 
 		 431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.141136  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0012  Flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding  32.02 
 
 		 430 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0849269  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1331  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.72 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.336617  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0810  Flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding  32.21 
 
 		 430 aa  112  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0480988  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0236  Flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding protein  31.19 
 
 		 431 aa  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.168088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2765  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), flavoprotein subunit  33.45 
 
 		 425 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3049  flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding  36.86 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.016263 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0011  Flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding  29.05 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000664715  hitchhiker  0.00735592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1674  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.82 
 
 		 437 aa  109  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1921  twin-arginine translocation pathway signal  30.58 
 
 		 437 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000266613  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4566  Flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding  35.84 
 
 		 426 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00485365  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1267  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), flavoprotein subunit  34.62 
 
 		 437 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.627541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1945  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.39 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.333887  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1737  flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding  29.69 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4363  twin-arginine translocation pathway signal  31.72 
 
 		 423 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0121845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1845  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.65 
 
 		 452 aa  98.6  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00111651  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0468  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), flavoprotein subunit  30.97 
 
 		 430 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0010  Flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding  27.61 
 
 		 430 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.011141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3048  Flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding  28 
 
 		 431 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0686  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.12 
 
 		 448 aa  96.3  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.354245  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4952  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.67 
 
 		 430 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.703499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1577  Flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding  28.05 
 
 		 430 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4247  twin-arginine translocation pathway signal  30.84 
 
 		 452 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4158  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.61 
 
 		 420 aa  90.5  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226366  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1514  flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding  33.97 
 
 		 421 aa  90.1  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3262  sulfide dehydrogenase flavocytochrome C oxidoreductase protein  35.17 
 
 		 431 aa  89.4  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4953  Flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding  28.02 
 
 		 421 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.353852  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1163  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.46 
 
 		 434 aa  87.8  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0728  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.25 
 
 		 424 aa  87.8  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4248  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.15 
 
 		 420 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4437  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), flavoprotein subunit  30.08 
 
 		 430 aa  85.9  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.993993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2577  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), flavoprotein subunit  29.39 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.413696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4364  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.99 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3460  Flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding  33.47 
 
 		 430 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2429  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), flavoprotein subunit  30.64 
 
 		 426 aa  82.8  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3426  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), flavoprotein subunit  30.29 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3911  hypothetical protein  30.43 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.981725  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3772  flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding  27.8 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2799  sulfide dehydrogenase [flavocytochrome c] flavoprotein chain  28.4 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.346372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3261  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), flavoprotein subunit  29.88 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252389  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1475  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), flavoprotein subunit  27.51 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355453  normal  0.473909 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3132  Flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding  33.05 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.94 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0519  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.61 
 
 		 425 aa  65.9  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000931088  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3137  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), flavoprotein subunit  26.18 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2035  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), flavoprotein subunit  26.16 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2866  Flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding protein  27.21 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.976481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0627  Flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding  31.35 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.62 
 
 		 460 aa  59.7  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43473  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1813  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), flavoprotein subunit  24.25 
 
 		 444 aa  52.8  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.289  normal  0.0740773 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2667  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.65 
 
 		 452 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1024  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  29.92 
 
 		 841 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0313  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.36 
 
 		 450 aa  50.8  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0244  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.78 
 
 		 452 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1454  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.62 
 
 		 411 aa  50.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0207  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.78 
 
 		 451 aa  50.8  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0050  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.77 
 
 		 429 aa  50.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.118378 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1298  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.09 
 
 		 489 aa  49.7  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.53579  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.62 
 
 		 449 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.809961  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.66 
 
 		 448 aa  47  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0245  nitrite reductase large subunit  27.56 
 
 		 858 aa  47  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2488  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.03 
 
 		 401 aa  46.6  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.584099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0099  sulfide dehydrogenase, flavoprotein subunit, putative  21.54 
 
 		 408 aa  46.2  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3036  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.43 
 
 		 414 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00637457  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2082  twin-arginine translocation pathway signal  23.57 
 
 		 491 aa  45.8  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1229  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.16 
 
 		 446 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.949165  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0836  fused NAD(FAD)-dependent dehydrogenase/rhodanese domain-containing protein  29.27 
 
 		 547 aa  44.3  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2082  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.23 
 
 		 379 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.107005  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0350  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.16 
 
 		 411 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0544  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.14 
 
 		 443 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000216248  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0530  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.14 
 
 		 443 aa  43.9  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000017098  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0457  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.59 
 
 		 421 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.772046 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09103  apoptosis-inducing factor (Eurofung)  24.84 
 
 		 561 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0266985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3201  hypothetical protein  25.8 
 
 		 431 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000763805  unclonable  0.00000506587 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3446  hypothetical protein  25.8 
 
 		 431 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0560  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.58 
 
 		 591 aa  42.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2526  putative sulfide quinone-rductase  27.8 
 
 		 433 aa  42.7  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.149353 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>