15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2500 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2500  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  804    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0940  hypothetical protein  96.41 
 
 		 254 aa  319  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.2166  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3201  hypothetical protein  41.19 
 
 		 610 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2090  hypothetical protein  29.85 
 
 		 618 aa  142  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3528  hypothetical protein  29.7 
 
 		 636 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2536  hypothetical protein  24.49 
 
 		 617 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4754  hypothetical protein  25.26 
 
 		 609 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3194  hypothetical protein  28.65 
 
 		 623 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0028  hypothetical protein  26.46 
 
 		 632 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1190  hypothetical protein  25.74 
 
 		 612 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204201  normal  0.1151 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3229  hypothetical protein  23.79 
 
 		 610 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3183  hypothetical protein  30.09 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3542  hypothetical protein  36.59 
 
 		 689 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1517  hypothetical protein  23.57 
 
 		 613 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675511  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_004310  BR0731  hypothetical protein  21.28 
 
 		 525 aa  44.3  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0530623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>