28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01741 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01741  signal peptide protein  100 
 
 		 106 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4655  signal peptide protein  68.63 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.104125 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4523  putative signal peptide protein  68.63 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  48.25 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2910  signal peptide protein  44.55 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0237846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5324  hypothetical protein  48.62 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549949 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6011  signal peptide protein  55.42 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2446  signal peptide protein  53.42 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0042  hypothetical protein  50.56 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0046  hypothetical protein  50.56 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0024  hypothetical protein  50.56 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1721  hypothetical protein  41.18 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169601  hitchhiker  0.0000197195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1352  hypothetical protein  34.07 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0017  hypothetical protein  41.57 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0202  hypothetical protein  44.19 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1508  hypothetical protein  38.54 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.620222  hitchhiker  0.000360892 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0024  hypothetical protein  41.57 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3156  putative signal peptide protein  41.41 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.910812  hitchhiker  0.0019491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2807  signal peptide protein  41.41 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1052  hypothetical protein  38.54 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1532  hypothetical protein  38.54 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2211  putative signal peptide protein  33.62 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3209  hypothetical protein  40.21 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0217  hypothetical protein  37.37 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5177  signal peptide protein  51.22 
 
 		 61 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4672  hypothetical protein  39.08 
 
 		 94 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951454  hitchhiker  0.00900362 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2531  hypothetical protein  47.06 
 
 		 179 aa  40.8  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2058  putative signal peptide protein  32.46 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>