22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3613 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3613  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1680  hypothetical protein  69.39 
 
 		 281 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1901  hypothetical protein  81.54 
 
 		 284 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2429  hypothetical protein  40.69 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4788  hypothetical protein  40.46 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3245  hypothetical protein  56.15 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  38.74 
 
 		 2449 aa  62.8  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  24.15 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  25 
 
 		 356 aa  52.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  23.68 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  24.54 
 
 		 1888 aa  52  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  27.44 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  30.28 
 
 		 1049 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  33.8 
 
 		 3333 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  41.98 
 
 		 484 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  34.94 
 
 		 2272 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  36.31 
 
 		 489 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  27.57 
 
 		 351 aa  45.8  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  40.98 
 
 		 423 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  27.66 
 
 		 472 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  28.28 
 
 		 356 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  30.43 
 
 		 450 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>