More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2897 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0951  para-aminobenzoate synthase, component I  52.01 
 
 		 705 aa  660    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.754558  normal  0.679604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2897  para-aminobenzoate synthase, component I  100 
 
 		 686 aa  1386    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0159595  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1044  para-aminobenzoate synthase, component I  50.99 
 
 		 704 aa  681    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.869303  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0310  para-aminobenzoate synthase subunit I  45.39 
 
 		 731 aa  622  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.764542  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3468  anthranilate synthase, component II  47.38 
 
 		 714 aa  622  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.841955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.45 
 
 		 732 aa  561  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00431194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1366  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.64 
 
 		 762 aa  557  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0518359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1666  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.61 
 
 		 700 aa  549  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2111  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.63 
 
 		 687 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0378177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4583  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.02 
 
 		 732 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3761  para-aminobenzoate synthase  46.23 
 
 		 703 aa  528  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0331515  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5650  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.86 
 
 		 672 aa  515  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1766  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.45 
 
 		 718 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3391  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.31 
 
 		 637 aa  437  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42151  predicted protein  38.71 
 
 		 760 aa  400  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.062393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.59 
 
 		 721 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1828  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.22 
 
 		 518 aa  319  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05730  4-amino-4-deoxychorismate synthase, putative  32.92 
 
 		 809 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  46.91 
 
 		 471 aa  303  6.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.77 
 
 		 466 aa  301  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.58 
 
 		 474 aa  300  9e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  39.82 
 
 		 495 aa  281  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  40.43 
 
 		 682 aa  280  8e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.92 
 
 		 719 aa  277  5e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.83 
 
 		 461 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1272  para-aminobenzoate synthase, component I  35.87 
 
 		 448 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.57 
 
 		 465 aa  266  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.9 
 
 		 480 aa  265  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  36.52 
 
 		 448 aa  263  6e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.34 
 
 		 472 aa  261  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.47 
 
 		 460 aa  254  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.99 
 
 		 464 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.64 
 
 		 469 aa  254  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  36.27 
 
 		 491 aa  253  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  43.25 
 
 		 468 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.16 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.84 
 
 		 466 aa  252  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.58 
 
 		 472 aa  251  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06300  aminodeoxychorismate synthase, component I  42.49 
 
 		 527 aa  249  8e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0721872  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1638  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.55 
 
 		 457 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2424  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.64 
 
 		 448 aa  244  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  39.23 
 
 		 454 aa  244  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  38.63 
 
 		 462 aa  244  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.63 
 
 		 480 aa  243  7.999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.34 
 
 		 458 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.89 
 
 		 466 aa  243  9e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1832  hypothetical protein  37.85 
 
 		 435 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.973309  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.56 
 
 		 454 aa  243  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2480  para-aminobenzoate synthase component I  37.06 
 
 		 512 aa  241  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.29 
 
 		 454 aa  242  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1582  anthranilate synthase component I  34.85 
 
 		 491 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000405168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.29 
 
 		 454 aa  241  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.29 
 
 		 454 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2940  anthranilate synthase component I  34.96 
 
 		 471 aa  241  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.256099 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.54 
 
 		 482 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151682  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1785  anthranilate synthase  33.2 
 
 		 505 aa  240  6.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  38.58 
 
 		 443 aa  240  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3994  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.79 
 
 		 493 aa  239  9e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.906481  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  36.11 
 
 		 496 aa  239  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0983  anthranilate synthase component I  35.36 
 
 		 474 aa  239  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.371518  normal  0.264118 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3888  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.25 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.353677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  35.99 
 
 		 491 aa  238  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0076  para-aminobenzoate synthase, component I  36.73 
 
 		 465 aa  238  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0064  anthranilate synthase  36.02 
 
 		 465 aa  238  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2156  anthranilate synthase component I  34.85 
 
 		 517 aa  238  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.849379  hitchhiker  0.00323016 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06550  para aminobenzoic acid synthetase (Eurofung)  27.43 
 
 		 823 aa  237  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0798538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  38.16 
 
 		 497 aa  237  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  37.56 
 
 		 430 aa  237  5.0000000000000005e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1731  anthranilate synthase component I  34.56 
 
 		 491 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1455  anthranilate synthase component I  35.26 
 
 		 514 aa  237  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0342  anthranilate synthase component I  34.22 
 
 		 469 aa  236  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0367738  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  37.43 
 
 		 430 aa  236  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0067  para-aminobenzoate synthase component I  35.31 
 
 		 480 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1003  anthranilate synthase, component I  35.43 
 
 		 517 aa  235  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.242829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4527  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  38.91 
 
 		 437 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.44 
 
 		 470 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0730  anthranilate synthase, component I  33.4 
 
 		 494 aa  234  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  36.07 
 
 		 458 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  36.07 
 
 		 458 aa  234  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0080  para-aminobenzoate synthase, component I  34.43 
 
 		 465 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0875  hypothetical protein  37.39 
 
 		 454 aa  235  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0064  para-aminobenzoate synthase component I  34.43 
 
 		 465 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.62 
 
 		 450 aa  234  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0068  para-aminobenzoate synthase component I  34.43 
 
 		 465 aa  234  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0064  para-aminobenzoate synthase component I  34.43 
 
 		 465 aa  234  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.07 
 
 		 458 aa  234  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0068  para-aminobenzoate synthase component I  34.43 
 
 		 465 aa  234  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5240  para-aminobenzoate synthase, component I  34.78 
 
 		 465 aa  234  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0077  para-aminobenzoate synthase, component I  34.43 
 
 		 465 aa  234  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000409192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  34.27 
 
 		 491 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3258  anthranilate synthase component I-like protein  36.06 
 
 		 511 aa  233  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0875  anthranilate synthase, component I  31.76 
 
 		 494 aa  232  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000225677  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1481  anthranilate synthase component I  31.92 
 
 		 485 aa  232  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  33.67 
 
 		 465 aa  232  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.94 
 
 		 509 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1256  Anthranilate synthase  38.28 
 
 		 443 aa  232  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0411  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  52.19 
 
 		 434 aa  232  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1291  anthranilate synthase component I  33.33 
 
 		 472 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  37.87 
 
 		 453 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.72 
 
 		 467 aa  231  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>