23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4487 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4487  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  226  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0501523  normal  0.111431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0345  CRISPR-associated protein Cas2  65.14 
 
 		 109 aa  153  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0897014  normal  0.0328291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0058  CRISPR-associated protein Cas2  57.14 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3118  CRISPR-associated protein Cas2  54.84 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1694  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.71 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1873  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.71 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1061  CRISPR-associated protein Cas2  45.16 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2008  CRISPR-associated protein Cas2  42 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.959025  normal  0.141931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0402  CRISPR-associated protein Cas2  40.78 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0097  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.6 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104167  normal  0.518264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0953  hypothetical protein  38.61 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0329  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.4 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1232  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.57 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1475  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.92 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0896  oxidoreductase, putative  37.37 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0465757  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0711  hypothetical protein  39 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000727859  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0452  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.04 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220536  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1949  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.66 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1904  hypothetical protein  34.26 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.246432  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0245  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.47 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22040  CRISPR-associated protein Cas2  40 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00451798 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2462  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.93 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196448  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf599  hypothetical protein  24.42 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000711932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>