24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2167 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2167  tyrosinase  100 
 
 		 416 aa  841    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649942  normal  0.0551649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1501  tyrosinase oxidoreductase protein  45.48 
 
 		 412 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.940598 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1947  tyrosinase  29.2 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.369199  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2156  tyrosinase/peptidase  28.18 
 
 		 495 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0211  tyrosinase  28.85 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965702  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0256  tyrosinase  28.85 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000141687 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1914  tyrosinase  28.85 
 
 		 874 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0747  tyrosinase  26.72 
 
 		 300 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  decreased coverage  0.0000143544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0968  tyrosinase  28.49 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.530534  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0527  tyrosinase  25.63 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3461  tyrosinase  27.27 
 
 		 281 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2941  tyrosinase  28.49 
 
 		 515 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0337  polyphenol oxidase B precursor  26.06 
 
 		 496 aa  53.1  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4746  tyrosinase  28.57 
 
 		 503 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6129  monophenol monooxygenase  47.06 
 
 		 536 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.452911 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6429  monophenol monooxygenase  47.06 
 
 		 536 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2427  polyphenol oxidase b precursor (catechol oxidase) oxidoreductase protein  23.26 
 
 		 506 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1836  tyrosinase  26.18 
 
 		 534 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1018  tyrosinase  32.61 
 
 		 666 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5336  tyrosinase  24.08 
 
 		 548 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1610  tyrosinase  24.57 
 
 		 493 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3575  Monophenol monooxygenase  29.17 
 
 		 971 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0316  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.97 
 
 		 690 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.833973  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_40017  tyrosinase  27.91 
 
 		 546 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>