More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1033 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1033  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 355 aa  719    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1141  glycosyl transferase, group 1  90.14 
 
 		 355 aa  653    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0760697 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3209  glycosyl transferase, group 1  81.36 
 
 		 355 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2781  putative glycosyl transferase  79.32 
 
 		 356 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692586  normal  0.55276 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0326  glycosyl transferase, group 1  78.41 
 
 		 355 aa  569  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0416  glycosyl transferase, group 1  77.27 
 
 		 355 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.552553  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2878  glycosyl transferase group 1  65.5 
 
 		 354 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0243297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1245  glycosyl transferase, group 1  65.5 
 
 		 354 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2254  sugar transferase, glycosyltransferase, group 1  63.35 
 
 		 355 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1948  glycosyl transferase group 1  63.64 
 
 		 355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.346715 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  62.78 
 
 		 354 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  62.78 
 
 		 417 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2145  glycosyl transferase group 1  65.2 
 
 		 354 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  64.91 
 
 		 354 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  62.78 
 
 		 354 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1042  glycosyl transferase group 1  64.91 
 
 		 354 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0861  glycosyl transferase group 1  64.62 
 
 		 354 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1050  glycosyl transferase group 1  62.43 
 
 		 356 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2811  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.83 
 
 		 354 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0568  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.83 
 
 		 354 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1136  glycosyl transferase group 1  64.91 
 
 		 354 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  64.62 
 
 		 354 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.83 
 
 		 354 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1757  glycosyl transferase, group 1 family protein  65.2 
 
 		 354 aa  461  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.748949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0113  putative glycosyltransferase  65.8 
 
 		 354 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.83 
 
 		 354 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0681  glycosyl transferase, group 1  64.91 
 
 		 354 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  61.93 
 
 		 354 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1160  glycosyl transferase, group 1  64.91 
 
 		 354 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  61.93 
 
 		 354 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.83 
 
 		 354 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.83 
 
 		 354 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2311  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.93 
 
 		 354 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1417  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.93 
 
 		 354 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2433  glycosyl transferase group 1 protein  61.93 
 
 		 354 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2870  glycosyl transferase group 1 protein  64.83 
 
 		 354 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2980  glycosyl transferase group 1  64.87 
 
 		 354 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172457  hitchhiker  0.000000269533 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3396  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.93 
 
 		 354 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1181  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.93 
 
 		 354 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2271  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.93 
 
 		 354 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.93 
 
 		 354 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.574417  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  61.65 
 
 		 354 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3821  glycosyl transferase group 1  65.52 
 
 		 354 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00699792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2162  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.93 
 
 		 354 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2857  glycosyl transferase, group 1  65.44 
 
 		 354 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135922  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0232  glycosyl transferase group 1  65.44 
 
 		 354 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0506  glycosyl transferase group 1  65.51 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.769782  normal  0.0165871 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0163  glycosyl transferase, group 1  64.87 
 
 		 354 aa  454  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0250  glycosyl transferase, group 1  65.44 
 
 		 354 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0176  glycosyl transferase group 1  65.16 
 
 		 354 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  64.87 
 
 		 372 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3861  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.79 
 
 		 354 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0083  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.79 
 
 		 400 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3352  glycosyl transferase, group 1  64.31 
 
 		 354 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3188  glycosyl transferase, group 1 family protein  66.57 
 
 		 354 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565728  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2866  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.23 
 
 		 354 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3942  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.51 
 
 		 354 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3110  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.23 
 
 		 354 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3441  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.23 
 
 		 354 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1678  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.23 
 
 		 354 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1388  glycosyl transferase group 1  62.78 
 
 		 354 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1363  glycosyl transferase, group 1  63.14 
 
 		 349 aa  425  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0232549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5322  glycosyl transferase group 1  59.77 
 
 		 376 aa  401  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0764086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1610  glycosyl transferase group 1  59.13 
 
 		 377 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.0108296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5555  glycosyl transferase group 1  59.42 
 
 		 379 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1908  glycosyl transferase group 1  58.55 
 
 		 377 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.446815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1626  glycosyl transferase group 1  58.55 
 
 		 377 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.726366  decreased coverage  0.00120235 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1230  glycosyl transferase group 1  57.39 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.377048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2321  glycosyl transferase group 1  59.08 
 
 		 408 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1780  glycosyl transferase group 1  57.95 
 
 		 354 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3692  glycosyl transferase, group 1  58.81 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5851  glycosyl transferase group 1  58.48 
 
 		 364 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3151  glycosyl transferase group 1  58.33 
 
 		 376 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5197  glycosyl transferase group 1  55.9 
 
 		 364 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0691  glycosyl transferase, group 1  58.02 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124167  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2112  glycosyl transferase, group 1  56.37 
 
 		 365 aa  378  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0844  putative glycosyltransferase  66.08 
 
 		 310 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0684167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1554  glycosyl transferase, group 1  55.01 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4899  glycosyl transferase group 1  55.46 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2712  glycosyl transferase group 1  56.45 
 
 		 370 aa  363  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0702  glycosyl transferase group 1  54.73 
 
 		 359 aa  349  5e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17290  UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase  54.36 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4020  glycosyl transferase group 1  56.92 
 
 		 339 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4766  glycosyl transferase group 1  51.56 
 
 		 374 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46838  normal  0.574205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0487  glycosyl transferase, group 1  53.78 
 
 		 355 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0235  glycosyl transferase group 1  50.88 
 
 		 365 aa  333  4e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000857963  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  51.14 
 
 		 360 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0911  glycosyl transferase group 1  48.13 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000886615  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1204  glycosyl transferase group 1  48.59 
 
 		 362 aa  319  5e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00332154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1356  glycosyl transferase, group 1  47.99 
 
 		 373 aa  316  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1263  glycosyl transferase, group 1 family protein  47.52 
 
 		 376 aa  309  4e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0920  glycosyl transferase group 1  47.21 
 
 		 362 aa  295  6e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0161  glycosyl transferase, group 1  45.51 
 
 		 365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  44.93 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4593  glycosyl transferase group 1  44.77 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3069  group 1 glycosyl transferase  41.14 
 
 		 357 aa  270  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0142  glycosyl transferase group 1  44.38 
 
 		 346 aa  269  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224106  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0199  glycosyl transferase group 1  44.67 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2561  glycosyl transferase, group 1  45.19 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0283  glycosyl transferase group 1  44.96 
 
 		 346 aa  256  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>